O Programa de Formação Profissional visa suprir a falta de profissionais especializados no mercado devido à crescente demanda da empresa, além de capacitar os atuais empregados e proporcionar o desenvolvimento de pessoas. O principal objetivo do programa é qualificar profissionais para trabalharem na operação ferroviária.

O Programa busca atender o aumento da produção prevista para os próximos anos; repor a saída de empregados com expectativa de aposentadoria e criar uma projeção de encarreiramento.

O treinamento é teórico e prático, conta com a parceria de instituições especializadas, como o SENAI, e desenvolve ainda atividades de operação assistida no campo. A formação interna de maquinistas contempla o aperfeiçoamento de operação de trens com atividades no Centro de Pesquisa e Treinamento (CEPET).